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但是，日本人类学者采纳这一论述之后，赋予其新的色彩。留下了史前遗迹的居民是“未开”民族，而外来的日本人则是摆脱了野蛮的征服者，人种的交替实际上是优胜劣汰的过程；这既和“记纪神话”的“神武东征”对应，也与当时风靡的社会达尔文主义密切结合。同时，将日本人与更早的居民割裂开，也就是将古老的野蛮人作为“他者”，树立起新的自我。

如前文所述，确实具有非常明显的殖民主义烙印。

日本近代人类学与殖民侵略的共谋，正如两部著作所揭示的，其方式是借由共通的术语、概念、制度来生产知识，要害在于过程而非结果。也就是说，即使学者的具体观点和当局所提倡的并不相同，然而没有意识形态根本上的断裂的话，依然助推了极端民族主义和军国主义。未参与战争者，也可能要承担战争责任，是这段历史留给全人类的沉痛教训。